杭州市第三人民医院眼科建立至今已有五十余年的历史，作为一个富有特色性的临床科室，目前在杭州市乃至浙江省的医疗领域中享有良好的声誉。已经开展的手术有白内障、青光眼、视网膜脱离、角膜移植、泪道、眼肌等各类型手术。目前科内主要的设备有：眼后节OCT扫描仪（深圳产）、眼电生理检查仪（重庆产）、静态视野仪（重庆产）、眼科 A 超（进口）、角膜地形图（进口）、眼底照相机（进口）、非接触性眼压机（进口）、多功能电脑验光仪（进口）、同视机（国产）、角膜曲率仪（进口）、间接眼底镜（苏州产），裂隙灯等一系列先进的检查和治疗设备。