齐齐哈尔市中医医院南区眼科是市重点专科，省中医眼科规培基地，市中医眼病治疗中心，中医针刺治疗视神经萎缩及眼肌麻痹、糖尿病视网膜病变及黄斑水肿、干眼症。同时开展中医穴位放血治疗多发麦粒肿和角结膜炎。同时中医特色治疗角膜炎、葡萄膜炎、视网膜色素变性等慢性疑难眼病。常规开展白内障手术、青光眼手术、翼状胬肉手术。