杭州西湖朝聚眼科医院在开展所有眼科医疗技术的同时，还与斯坦福大学眼科中心成为友好医院，并与各眼科中心建立多层次的合作关系，并在院内成立眼科疑难疾病会诊中心。设有白内障科、科、眼表病科、斜弱视科、眼外伤科、眼底病科、眼眶和美容科、准分子近视治疗科、视光部等15个临床科室，可开展眼角膜移植术、非穿透性抗术、玻璃体切割术、复杂性视网膜脱离复位手术、眶内肿物摘除等高难度手术。