陕西中医药大学第二附属医院眼科是现代化的眼病诊疗科室，具有全新服务理念，在投入巨资引进先进的眼科设备的同时，还将国内外眼科治疗的新技术、新手段、新理念引入咸阳，以提高西部地区的整体眼科水平。设有：白内障专科（全新超声乳化五分钟治疗白内障）、青光眼专科、近视激光治疗专科、视光学专科（医学验光配镜）、眼底病专科、泪道疾病专科、眼外伤专科、儿童斜视、弱视矫正专科等。