同仁医院是一所以眼科、耳鼻咽喉科和心血管疾病为重点的现代化大型综合医院。眼科和耳鼻咽喉头颈外科是教育部重点学科；设在医院南区的首都医科大学北京眼科学院和耳鼻咽喉科学院是国家科学与技术人才培养基地；医院兼有北京市眼科研究所和北京市耳鼻咽喉科研究所（WHO防盲合作中心），附设北京同仁眼库（国际眼库协会会员），设有北京市眼耳鼻咽喉科疾病研究中心和北京市糖尿病防治办公室。开放病床1200张。