牡丹江医学院第二附属医院眼科是牡丹江地区眼科疾病的重点科室。科室开放病床20张，年门诊量超过10000人次，年手术量约800台次。科室仪器设备先进，拥有目前先进的AMO白星超声乳化仪，玻璃体切割仪、Topcon手术显微镜，免散瞳照相机等。1990年在牡丹江市率先开展现代白内障囊外摘除联合人工晶体植入术，1998年开展小切口囊外摘除联合人工晶体植入术，2007开展先进的超声乳化联合折叠式人工晶体植入术，并承担了“百万贫困白内障患者复明工程”，为近2000名患者成功复明，赢得社会广泛赞誉。